Également connus sous le nom de « champignons imparfaits », les Deuteromycota constituent un groupe controversé de champignons. Leur classification a été en constante évolution car il s’agit d’un mode d’agrégation pour l’identification qui ne reflète pas les relations phylogénétiques. Cela fait que la manière de classer les deutéromycètes est en perpétuel changement et qu’il n’existe pas encore de méthode satisfaisante pour le faire.
Pourtant, il s’agit d’un groupe très intéressant compte tenu de ses implications dans la nature et de son importance pour l’être humain. Si vous souhaitez en apprendre davantage sur ce que sont, les caractéristiques des deutéromycètes et des exemples, nous vous invitons à poursuivre la lecture de cet article.
Que sont les deutéromycètes et leurs caractéristiques
On les appelle “champignons imparfaits” car ils ne possèdent pas de phase sexuelle reproductrice. De plus, présentent certaines caractéristiques qui permettent de les identifier, voyons-en quelques-unes :
- Ils se reproduisent de manière asexuée: généralement par des spores asexuelles appelées conidies. Nous en parlons plus sur la Reproduction asexuée : en quoi cela consiste, les types et des exemples dans cet article.
- La plupart présentent un micélium formé d hyphes septés: ces hyphes ramifiés contiennent de multiples noyaux.
- Ils disposent de chitine-glucane: il s’agit du composant principal de la paroi cellulaire des deutéromycètes.
- Sont saprotrophes et parasites facultatifs opportunistes: principalement sur des plantes et quelques-uns d’autres champignons, animaux et même l’être humain. Ne manquez pas cet article sur les Saprotrophes : qu’est-ce que c’est et des exemples.
- Sont largement utilisés dans le domaine de la biotechnologie: certains interviennent dans des processus de fermentation, d’autres pour la production de médicaments et d’autres comme agents de lutte biologique contre les parasites. Peut-être vous intéressera consulter le post suivant sur Qu’est-ce que la biotechnologie et à quoi sert-elle.
- Peuvent générer des maladies chez l’humain: notamment des affections cutanées et des muqueuses.
Taxonomie des deutéro-mycètes
Au départ, la classification des champignons se basait sur leur cycle de vie et leur morphologie; c’est là que les Deuteromycota constituaient un groupe à part, regroupant les champignons dont la phase sexuelle n’existait pas ou était inconnue.
Par la suite, avec l’avancée de la technologie et des analyses moléculaires, on a découvert que bon nombre de champignons classés comme champignons imparfaits étaient en réalité des ascomycètes. Depuis lors, de nombreux champignons ont été reclassés comme Ascomycota ou Basidiomycota, tandis que dans d’autres cas le terme deutéro-mycète est utilisé pour désigner la phase asexuée d’un ascomycète, donnant à un même organisme deux noms scientifiques.
C’est pourquoi on dit qu’il s’agit d’un groupe hétérogène et polyphylétique, car il ne s’agit pas d’un seul linage évolutif et qu’il n’existe pas nécessairement de rapports ancestraux directs. Actuellement, le groupe comprend 2 828 genres et 16 200 espèces.
Classification des deutéro-mycètes
Certains auteurs ont divisé les deutéro-mycètes en trois ordres artificiels : Moniliales, Sphaeropsidales et Melanconiales, mais cette classification est désormais abandonnée. D’autres proposent de distinguer les champignons imparfaits sur la base de données morphologiques, notamment par les conidies et leur formation.
Ainsi, on obtient deux groupes composés de :
Hyphomycetes
Ceux qui possèdent des conidiophores libres, regroupés de manière lâche ou sans conidies. On les appelle “moisissures” en raison de leur apparence poudreuse. On peut les subdiviser en :
- Hyphomycetales: possèdent des conidiophores libres.
- Tuberculariales: possèdent des conidiophores dans des sporodoques (un ensemble lâche d’hyphes).
- Agonomycetales: n’ont pas de conidies (les hyphes sont stériles).
Coelomycètes
Dans cette classification des deutéro-mycètes, on trouve ceux qui possèdent des structures reproductives plus complexes appelées conidiomes, au sein desquels se trouvent les conidiophores. Selon la forme du conidiome, ils peuvent être rangés dans les catégories suivantes :
- Melanconiales: les conidiomes sont acérvulaires (en forme d’ampoule).
- Sphaeropsidales: les conidiomes sont des picnidies (en forme de poire).
Habitat des deutéro-mycètes
On peut les trouver dans une grande variété d’habitats. La plupart vivent dans le sol, bien qu’ils aient été détectés dans des environnements aquatiques et même dans l’air.
Par ailleurs, certains d’entre eux sont plus sélectifs quant à leur milieu, tandis que d’autres peuvent croître dans des conditions variées. Même ceux qui sont parasites d’autres organismes peuvent être spécifiques à un seul hôte ou en avoir plusieurs.
Cycle de vie des deutéro-mycètes
Le cycle de vie des deutéro-mycètes inclut uniquement la phase asexuée, car la phase sexuelle peut avoir été perdue au cours de l’évolution ou rester inconnue.
La reproduction des deutéro-mycètes peut se faire par :
- Les spores : les conidies, spores asexuelles, se forment par mitose à l’extrémité des hyphes spécialisés, les conidiophores. Ces derniers peuvent être totalement libres, réunis lâchement ou dans des corps fructifères appelés conidiomes. Les spores haploïdes sont transportées par le vent, l’eau ou un vecteur biologique; à la germination, elles donnent naissance à des hyphes avec des noyaux haploïdes capables de générer de nouvelles spores et de relancer le cycle. Découvrez ce que sont les spores, ici.
- Par fragmentation : une rupture spontanée et une séparation des cellules qui composent l’hype surviennent; celles-ci peuvent se comporter comme des spores, se développant et donnant naissance à un nouvel organisme.
- Par bourgeonnement du mycélium : une germe se forme par division cellulaire de l’hype, elle grossit et se sépare finalement de l’hype mère pour former un nouvel organisme. Dans cet article de Info Utiles, nous vous en disons plus sur le bourgeonnement : qu’est-ce que c’est et des exemples.
Importance des deutéro-mycètes
Beaucoup de champignons imparfaits sont considérés comme des parasites d’animaux et de plantes. Ils peuvent causer d’importantes maladies chez l’humain, comme par exemple le pied d’athlète et d’autres infections cutanées, des ongles et des muqueuses. Certains produisent des mycotoxines, la substance cancérigène d’origine naturelle la plus gravement connue.
Mais n’en faisons pas une mauvaise réputation ! Voici quelques-unes des importances des deutéro-mycètes :
- Pénicilline : l’une des découvertes les plus importantes en médecine, c’est un antibiotique obtenu à partir de champignons deutéro-mycètes appartenant au genre Penicillium.
- Transplantation d’organes : la ciclosporine est un composé synthétisé par un champignon imparfait (Tolypocladium inflatum) et a entraîné une augmentation significative du nombre de greffes d’organes réussies. La raison est que la ciclosporine empêche les réactions immunitaires qui surviennent lors d’un rejet de greffe.
- Contrôle biologique : il s’agit de la capacité de certains organismes à réguler les populations d’autres organismes. Par exemple, certaines espèces de champignons imparfaits se nourrissent d’insectes et de nematodes; tandis que des espèces du genre Trichoderma sont utilisées pour combattre les champignons nuisibles des cultures agricoles. Vous pouvez trouver ici plus d’informations sur le Contrôle biologique des parasites : ce que c’est, avantages, inconvénients et exemples.
- Production d’aliments et de boissons : par exemple certains champignons du genre Penicillium sont utilisés pour l’élaboration de certains fromages comme le roquefort.
- Biorémédiation : l’espèce Aspergillus niger a démontré une tolérance à certains métaux contaminants, ce qui pourrait être utilisé pour la récupération d’écosystèmes pollués. N’hésitez pas à lire cet article sur la Biorémédiation : qu’est-ce que c’est, les types et des exemples.
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- Amerio NS, Castrillo ML, Bich GA, Zapata PD, Villalba LL. (2020). Trichoderma en l’Argentine : État de l’art. Ecologie austral 30(1).
- Curtis H, Barnes NS, Schnek A, Massarini A. (2008). Biologie 7e édition. Editorial Médica Panamericana.
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